Техасские ученые создали язык программирования для биохимических реакций

Возврат к списку

Техасские ученые создали язык программирования для биохимических реакций

11.10.2018     

Техасские исследователи создали язык программирования (ЯП) для химиков. Он позволяет описывать химические формулы языком, понятным человеку, легко вносить изменения и проверять их.

Зачем нужен новый язык?

Биохимики давно пытаются разработать инструмент, который позволил бы выстраивать структуру требуемого вещества с необходимыми свойствами. Зачастую их можно предсказать, но этот метод не всегда дает необходимый результат. Работая над решением этой проблемы, ученые из Техасского университета в Остине, США, создали химический язык программирования. Он получил название CRN++.

Молекулы взаимодействуют между собой посредством химических реакций, а CRN++ позволяет описать этот процесс математическим языком и запрограммировать биохимическую систему на определенные действия. Это похоже на принцип действия химического контроллера. С помощью CRN++ можно описать любые типы химических реакций.

Авторы нового ЯП поясняют, что благодаря их проекту ученые могут перевести сложные реакции в цифровой формат. Это позволит написанный на CRN++ код воспроизводить в неизменном виде на любом компьютере с одним и тем же результатом. Также появляется возможность изменять и модифицировать написанные алгоритмы, искать в них ошибки и при этом не использовать долгие и трудоемкие расчеты.

Особенности реализации

Ключевой особенностью реализации разработки стала возможность учитывать множество биохимических факторов и моделировать их взаимодействие. Авторы CRN++ относят созданный язык к императивной парадигме программирования. Несмотря на то, что код может показаться похожим на ассемблер, разработчики выступают против такого сравнения. По их словам, CRN++ не следует относить к машинным языкам – специфика описания химических реакций требует частого использования абстракций, поэтому проект ученых работает на более высоком уровне.

Пример реализации алгоритма, вычисляющего числа Фибоначчи на языке CRN++:

 

 

Последовательность Фибоначчи – математическая последовательность, каждый член которой является суммой двух предыдущих. Если энный член последовательности обозначается хn, то для всей последовательности справедливым будет уравнение: хn+2=хn+хn+1, первыми двумя членами которого будут x1=l и x2=1. Порядок последовательности при этом таков: 1, 1, 2, 3, 5, 8, 13, 21..., следующим числом будет 34, так как сумма 13 и 21 равна 34 и т.д.

Также авторы CRN++ проводят параллель с другими популярными языками вроде C, Java или Python. Разработка преследует те же цели, что и эти ЯП – упростить представление машинного кода для человека и дать инструменты для краткого описания сложных структур данных. Поэтому в CRN++ можно встретить привычные конструкции if/else и циклы. Чаще всего для программирования химических реакций применяются последовательные ветвящиеся алгоритмы, что также роднит новый ЯП с другими высокоуровневыми представителями императивной парадигмы.

«Мы предлагаем язык программирования, который соответствует всем типам химических реакций. При этом CRN++ – язык с открытым кодом, так что ученые могут вносить в него свои поправки и улучшать так, как им необходимо», – комментирует разработку Марко Васик, аспирант Техасского университета, один из авторов проекта.

Исходный код языка и примеры использования доступны на GitHub. Техническая документация опубликована на сайте библиотеки Корнеллского университета.

Проблемы биохимического программирования

Главный недостаток CRN++ на данный момент – погрешности при описании химических реакций. Из-за того, что язык манипулирует реальными показателями концентраций биохимических элементов, не всегда удается достичь идеального выходного значения – неизбежно встречаются отклонения.

Сейчас ученые пытаются минимизировать количество ошибок, используя доступные инструменты анализа.



Источник: https://infostart.ru/journal/news/tekhnologii/tekhasskie-uchenye-sozdali-yazyk-programmirovaniya-dlya-biokhimicheskikh-reaktsiy_920882/
Автор:
Александр Вашкевич Аналитик


Доводилось ли вам работать с машинными языками программирования?


Да, довольно часто (6.67%, 1 голосов)
6.67%
Совсем немного (40%, 6 голосов)
40%
Сталкивался с ними только на занятиях (20%, 3 голосов)
20%
Нет, не доводилось (33.33%, 5 голосов)
33.33%

Комментарии
Избранное Подписка Сортировка: Древо
1. PerlAmutor 54 11.10.18 14:49 Сейчас в теме
Думаю с машинными языками программирования работают так или иначе большинство программистов. Невозможно отлаживать программы на C/C++ или пытаться поломать игрушку с помощью CheatEngine не имея базовых знаний в ассемблере.
2. Infector 147 11.10.18 20:01 Сейчас в теме
Придумайте что-нибудь для законотворцев, чтобы яснее мысли излагали.
pm74; kamsky93; awk; nyam-nyam; +4 Ответить
3. vpaoli 29 12.10.18 11:46 Сейчас в теме
так это наш знакомый 1С . Меняем ПланСчетов, РегистрРасчета и т.п. на Улеводороды, Валентности и т.п. и получаем CRN++. Вообщем ничего нового.
Оставьте свое сообщение

См. также

Ubuntu побил Windows 10 в тесте на производительность

Новость Windows Linux

Основатель Phoronix Media и главный разработчик Phoronix Test Suite Майкл Ларабел протестировал производительность двух операционных систем – Windows 10 и предстоящего дистрибутива Ubuntu 20.04 LTS Linux на ноутбуке за 199 долларов.

вчера в 13:55    554    SKravchenko    11       

Минкомсвязь разрешит Apple и Samsung разблокировать технологию Wi-Fi 6

Новость Apple Гаджеты Минкомсвязь

В России скоро может появиться возможность сертифицировать устройства с поддержкой Wi-Fi 6. Новая технология будет разблокирована на смартфонах Apple, Samsung и Huawei.

18.02.2020    619    VKuser24342747    1       

На заводе телеграфных аппаратов в Калуге запустят производство смартфонов

Новость Гаджеты Импортозамещение

В марте 2020 года на Калужском заводе телеграфных аппаратов начнется серийный выпуск защищенных российских смартфонов и планшетов MIG S6 и MIG T8X.

17.02.2020    832    AnastasiaKl    11       

Кто выиграет и проиграет когда Google откажется от сторонних cookies

Новость Google Веб Интернет

Google заявил, что к 2022 году Chrome перестанет принимать сторонние cookie-файлы. Попробуем выяснить, кому и чем это грозит.

17.02.2020    723    SKravchenko    0       

Больше возможностей: представлен релиз ядра Linux 5.5

Новость Linux

Cоздатель операционной системы – Линус Торвальдс традиционно представил важное обновление ядра Linux 5.5. Работа над изменениями заняла у команды около двух месяцев.

05.02.2020    2175    user1015646    7       

Робот-бухгалтер сэкономил российской компании 50 млн рублей за год

Новость Бухучет Робототехника

В среде программистов ходит шутка о том, что в будущем целые ведомства заменит один небольшой скрипт. В «Билайне» сделали важный шаг в этом направлении: робот-бухгалтер RobBee сократил годовые расходы компании на 50 млн рублей и уже окупился.

31.01.2020    3492    user1015646    42       

Текст, написанный ИИ, впервые защитили авторским правом

Новость Развлечения, искусство, спорт Искусственный интеллект

Суд в китайском Шэньчжэне защитил авторским правом статью, созданную с помощью искусственного интеллекта. Это первый судебный прецедент, который позволяет расценивать ИИ как творческую силу. 

30.01.2020    1285    SKravchenko    6       

На рынок вышел смартфон без операционной системы

Новость Linux Гаджеты

Компания Pine Microsystems представила новый смартфон PinePhone Braveheart Edition. Устройство продается без операционной системы – установить один из дистрибутовов Linux придется самостоятельно.

28.01.2020    2944    user1015646    27       

PlayStation 5: новый логотип – новые функции

Новость Видеоигры

На пресс-конференции Sony, в рамках выставки CES 2020, компания представила логотип новой игровой консоли PlayStation 5, выпуск которой запланирован на 2020 год.

24.01.2020    1856    SKravchenko    3       

Рейтинг языков программирования TIOBE назвал самый популярный язык 2019 года

Новость Рейтинг Языки программирования

Первым, по версии составителей рейтинга TIOBE, ожидаемо стала Java, а второе место неожиданно досталось C. Серебряный призер рейтинга обогнал Python – лидера 2007, 2010 и 2018 годов. 

21.01.2020    2824    user1015646    19       

Доступно для всех: вышло приложение GitHub для Android

Новость GitHub Мобильные приложения

Крупнейший на планете хостинг репозиториев GitHub представил официальное приложение для Android. Ссылки на загрузку бета-версии получили пользователи, которые заранее оставили заявки на GitHub. 

21.01.2020    1676    user1015646    3       

Большие перемены: Google откажется от приложений для Chrome и сторонних cookies

Новость Google Интернет

Google рассказал о двух крупных изменениях в своей политике: компания перестанет поддерживать сторонние cookies в браузере Chrome и откажется от приложений для него. 

20.01.2020    2286    user1015646    1       

В России появится «медицинский» ИИ на отечественных нейропроцессорах 

Новость Искусственный интеллект Медицина Нейросети

Российские разработчики создадут программно-аппаратную базу для системы искусственного интеллекта, которую планируется использовать в медицине. Для ее создания задействуют отечественные нейропроцессоры.

17.01.2020    2131    user1015646    3       

Amazon представила библиотеку для создания приложений с применением ИИ

Новость Amazon Искусственный интеллект

Чтобы создать приложение с помощью ИИ, разработчику достаточно написать всего три строки кода. 

16.01.2020    2025    AnastasiaKl    7       

Microsoft предложила купить новый ПК вместо обновления старого до Windows 10

Новость Microsoft

Поддержка Windows 7 прекращается 14 января. Microsoft напоминает пользователям, что их устройство может не поддерживать «десятку», и рекомендует вместо обновления купить новый компьютер. 

14.01.2020    2390    VKuser24342747    20       

Российский программист создал сервис, который может продолжить любую историю за рассказчика

Новость Искусственный интеллект Маск Нейросети

Разработчик Михаил Гранкин создал сервис «Порфирьевич», который умеет дописывать тексты на русском языке. Гранкин взял за основу нейросеть GPT-2 компании OpenAI. Один из основателей компании – Илон Маск, создатель Tesla и SpaceX. 

09.01.2020    9677    user1015646    15       

Apple отключила чип для Bluetooth в российских iPhone 11 из-за запрета Роскомнадзора

Новость Apple Роскомнадзор

Apple попросила Роскомнадзор выдать лицензию на частоты, необходимые для использования новой технологии беспроводной передачи данных. Из-за отказа ведомства компания отключила в России чип, необходимый для этой функции. 

24.12.2019    2983    VKuser24342747    38       

Система госзакупок засбоила после перехода на свободное ПО

Новость Госзакупки Мобильные приложения Тендер

Модуль в системе госзакупок, который отвечает за взаимодействие с электронными площадками и внешними решениями, решили перевести на ПО с открытым исходным кодом. В результате перехода система больше суток работала со сбоями.

23.12.2019    1967    user1015646    6       

Путин подписал указ о переводе российских больниц на электронный документооборот

Новость Здравоохранение, медицина, стоматология Путин Цифровая экономика

Президент России Владимир Путин утвердил несколько поручений, направленных на цифровизацию здравоохранения. Среди них – внедрение электронного документооборота в больницах страны. 

19.12.2019    2763    user1015646    8       

Экспертный совет: «Яндекс» значительно обновил поисковую систему

Новость Интернет Яндекс

«Яндекс» представил обновление «Вега» для своей системы поиска. В сервисе появилось более 1500 нововведений и улучшений. Главная особенность – функция экспертного поиска. 

19.12.2019    2163    VKuser24342747    4       

ИИ от Amazon освободит врачей от бумажной работы и поможет пациенту прочесть рецепты

Новость Amazon Искусственный интеллект Нейросети

Разработчики представили нейросеть Transcribe Medical. Она слушает беседу врача и пациента и помогает вести медицинские записи.

19.12.2019    1880    user1015646    1       

Russian AI Cup 2019: стартовал чемпионат Mail.Ru Group по программированию искусственного интеллекта

Новость Искусственный интеллект Нейросети

Участвовать в Russian AI Cup 2019 могли все желающие – от студентов профильных вузов и фанатов передовых технологий до профессиональных разработчиков.

17.12.2019    2557    user1015646    14       

Вот так сюрприз: в самом копируемом фрагменте Java-кода нашли ошибку

Новость Языки программирования

Сайт StackOverflow – популярная система вопросов и ответов о программировании. Но не все советы коллег одинаково полезны: в самом цитируемом куске кода на Java, представленном на StackOverflow, обнаружили серьезный баг.

16.12.2019    3428    user1015646    3       

Команда из России превратила Python-хакатон в свой мастер-класс

Новость Языки программирования

В Бахрейне прошел ИТ-марафон GeoHack-2019. Команды должны были создать нейронные сети для обработки данных с месторождений нефти.

13.12.2019    2543    user1015646    3       

Google начал учитывать контекст слов при русскоязычном поиске

Новость Google Интернет Нейросети

Компания Google обновила алгоритмы для поиска по русскоязычным сайтам. Это крупнейший апдейт системы за последние пять лет. Его главная цель – улучшить результаты выдачи. 

13.12.2019    1936    VKuser24342747    3